在选择万方查重要点时，首先要考虑毕业设计的主题和研究内容。根据设计的学科领域和研究方向，确定需要查重的重点部分。其次，可以结合导师的建议和要求，选择万方查重要点。同时，还可以参考相关文献和研究成果，找到合适的查重重点。最后，要注意保护个人隐私信息，确保查重的准确性和安全性。

另外，在选择万方查重要点时，还需要考虑文献的权威性和可信度。选择具有较高检测精度和准确率的万方查重工具，确保查重结果的可靠性。同时，要注意避免选择过于广泛或模糊的查重范围，应该重点查重设计中的核心内容和创新点。通过合理选择万方查重要点，可以有效提升毕业设计的质量和学术水平。